A ENECON realiza também as atividades com resgate de flora nas frentes de obra, já que dependendo da região onde ocorre o empreendimento, faz-se necessário a supressão de vegetações que podem se encontrar em estágio sucessionais distintos.
O resgate da flora ocorre através da coleta de material botânico, principalmente de espécies de interesse ecológico ou medicinal de forma a proporcionar sua preservação. O material é desenvolvido em viveiros que posteriormente fornecem materiais para programas de revegetação atendimento de medidas compensatórias ou mitigadoras junto a condicionantes ambientais.